不少民眾以為，農地只要實際作農業使用，就能免課土地增值稅，但實務上，一個關鍵時間點若沒踩準，稅單往往照樣寄到。尤其是「法院拍賣農地」，更是許多拍定人與原地主最容易忽略的高風險情境。
新竹縣稅務局指出，農地若因法院拍賣移轉所有權，稅務機關會先依法核課土地增值稅，並以雙掛號通知拍定人（新所有權人）及原所有權人。即便該筆農地在拍定當下符合「農地農用」規定，也不會自動免稅，仍須由當事人主動提出申請。
稅務局提醒，若農地在拍定時確實作農業使用，新、舊所有權人必須在收到稅務局通知的次日起30日內，檢附「農業用地作農業使用證明書」，向稅務機關申請不課徵土地增值稅。一旦超過期限，即使農地實際仍在耕作，也將喪失免稅資格。
值得注意的是，申請流程並非只向稅務局遞件即可，當事人還必須在這30日內，向土地所在地的鄉鎮市公所申請核發「農業用地作農業使用證明書」。公所實際核發證明的作業時間，雖可自30日期限中扣除，但若超過30日後才向公所提出申請，仍視同逾期，無法適用免稅規定，是實務上最常踩雷的環節。
此外，即使後續經核定符合免稅條件、產生應退還的土地增值稅，這筆款項也不會直接退給拍定人或原地主。稅務局說明，法院拍賣案件中的退稅款，屬於拍定價款的一部分，須交由執行法院依債權順位重新分配，待分配完成後，如仍有餘額，才會由法院退還給債務人。
稅務人員提醒，法院拍賣農地牽涉稅務、司法與行政程序，時間點與文件缺一不可，無論是原地主或拍定人，都不應抱持「農地就一定免稅」的想法，否則一個疏忽，往往就是數十萬甚至上百萬元的稅負差距。
